Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms