Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TMUB1Q9BVT8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TMUB1Q9BVT8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TMUB1Q9BVT8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TMUB1Q9BVT8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TMUB1Q9BVT8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TMUB1Q9BVT8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TMUB1Q9BVT8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TMUB1Q9BVT8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMUB1Q9BVT8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMUB1Q9BVT8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMUB1Q9BVT8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMUB1Q9BVT8 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMUB1Q9BVT8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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