Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms