Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms