Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms