Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD6Q96NE9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms