Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms