Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms