Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms