Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms