Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms