Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PYDC1Q8WXC3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms