Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms