Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms