Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms