Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms