Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms