Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 FANCI-217ENST00000570225 526 ntTSL 33.14□□□□□ -1.914e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 EIF4E-211ENST00000515638 738 ntTSL 51.91□□□□□ -2.11e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.241e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-204ENST00000413831 891 ntTSL 50.81□□□□□ -2.288e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ANAPC4-205ENST00000505842 636 ntTSL 30.5□□□□□ -2.331e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 SRP54-204ENST00000553923 573 ntTSL 20.35□□□□□ -2.354e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 EIF4E-210ENST00000511644 686 ntTSL 50.16□□□□□ -2.381e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 PPP5C-203ENST00000467502 1235 ntTSL 212.91□□□□□ -0.348e-13■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0A1-220ENST00000588901 589 ntTSL 215.28■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 212.64□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 512.16□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.724e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 210.11□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 PPP6R1-202ENST00000586690 668 ntTSL 210.27□□□□□ -0.775e-10■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.14e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-207ENST00000436324 1045 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-210ENST00000464078 508 ntTSL 515.35■□□□□ 0.054e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-206ENST00000431390 1552 ntTSL 314.71□□□□□ -0.054e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-208ENST00000443046 823 ntTSL 312.92□□□□□ -0.344e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-216ENST00000486741 4299 ntTSL 211.27□□□□□ -0.614e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-220ENST00000492280 2707 ntTSL 59.92□□□□□ -0.824e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-201ENST00000288344 1303 ntTSL 27.82□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-205ENST00000419378 850 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-11■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIM66-208ENST00000531498 1210 ntTSL 1 (best)7.6□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 AP1B1-207ENST00000421126 1908 ntTSL 510.16□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 212.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.329e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF337-203ENST00000481610 572 ntTSL 34.97□□□□□ -1.619e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CARS2-212ENST00000537386 739 ntTSL 416.34■□□□□ 0.218e-10■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CARS2-225ENST00000541362 1051 ntTSL 215.6■□□□□ 0.098e-10■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CARS2-232ENST00000545506 788 ntTSL 314.24□□□□□ -0.138e-10■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 PDE8A-207ENST00000557954 586 ntTSL 40.63□□□□□ -2.316e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 RBM17-203ENST00000432931 805 ntTSL 318.12■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FARP2-205ENST00000418082 456 ntTSL 48.81□□□□□ -12e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-15■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TRMT1-223ENST00000593257 408 ntTSL 413.17□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 510.4□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 310.4□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.185e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.03□□□□□ -1.935e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 AES-204ENST00000585782 505 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-10■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TXLNGY-206ENST00000459719 2098 ntTSL 212.44□□□□□ -0.422e-38■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TXLNGY-205ENST00000447520 832 ntTSL 211.07□□□□□ -0.642e-38■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.642e-38■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TXLNGY-208ENST00000538014 2018 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-38■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TXLNGY-204ENST00000447202 2761 ntTSL 26.5□□□□□ -1.372e-38■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.937e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ALG5-205ENST00000496689 756 ntTSL 56.92□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-225ENST00000583834 1993 ntTSL 314.09□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-227ENST00000584022 1103 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 NAT9-207ENST00000579218 583 ntTSL 59.73□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ACP1-208ENST00000442386 546 ntTSL 416.48■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ACP1-206ENST00000413140 689 ntTSL 29.9□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ACP1-202ENST00000272067 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ACP1-209ENST00000453390 577 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 FN1-225ENST00000494446 676 ntTSL 26.47□□□□□ -1.372e-18■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-212ENST00000584079 382 ntTSL 57.44□□□□□ -1.229e-14■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.898e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.898e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 DLST-211ENST00000555988 718 ntTSL 57.21□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 EPAS1-206ENST00000466465 3622 ntTSL 27.35□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIOBP-208ENST00000418339 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIOBP-207ENST00000417857 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.42□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIOBP-210ENST00000452519 586 ntTSL 412.54□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIOBP-201ENST00000331103 513 ntTSL 311.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 PLCG1-208ENST00000477870 1051 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 ANKFY1-206ENST00000572564 2555 nt9.5□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 27.5
PRPF8Q6P2Q9 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.475e-7■■■■■ 27.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1128.8 ms