Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms