Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms