Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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