Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms