Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RRN3P1Q2M238 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms