Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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