Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFA9Q16795 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms