Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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