Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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