Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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RPE65Q16518 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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RPE65Q16518 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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