Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
GRK1Q15835 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GRK1Q15835 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms