Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms