Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MLC1Q15049 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms