Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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