Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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