Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms