Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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