Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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