Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms