Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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