Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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