Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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