Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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