Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FOXI1Q12951 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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FOXI1Q12951 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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