Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN1Q12860 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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