Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SCRN1Q12765 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SCRN1Q12765 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SCRN1Q12765 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SCRN1Q12765 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRN1Q12765 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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