Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSRP1Q08945 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms