Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms