Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms