Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms