Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms