Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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